Plateforme de recherche et d’innovation en spectrométrie de masse et métabolomique – IBISA (PRISMM)
Biologie intégrative imagerie santé environnement
Organisation
Responsables
Raphaël Delépée
02 31 45 51 13
raphael.delepee@unicaen.fr
Responsable scientifique adjoint : Valérie BOUCHART (LABÉO) | 02 31 47 19 19
Responsable technique : Adeline CLERGÉ (UNICAEN) | 02 31 45 51 37
Présentation
PRISMM est une plateforme Universitaire de l’unité de service PLATON. La plateforme met en œuvre des approches ciblées et non ciblées pour la quantification ou l’identification de biomarqueurs de faible poids moléculaire (<2000 g/mol) par des techniques de chromatographies couplées à la spectrométrie de masse (UHPLC-MS/MS, UHPLC-HRMS et UHPLC-HRMS/MS, GC- MS/MS). Une partie importante des analyses réalisées au sein de PRISMM sont en lien avec des expositions professionnelles et environnementales. La plateforme recherche également les biomarqueurs d’effets biologiques associés à ces expositions.
PRISMM regroupe les savoir-faire de chimistes analystes de l’Université de Caen Normandie et de l’axe Santé Publique & Environnement du pôle R&D et Innovation du GIP LABÉO.
Activités
La plateforme est ouverte aux laboratoires publics ou privés régionaux, nationaux et internationaux.
La plateforme propose le dosage de biomarqueurs d’exposition à partir d’échantillons de natures très variées. Par exemple :
- Etudes métabolomiques non ciblées dans l’urine, le cerveau, la salive, le sang, … (séparation en phase inverse et/ou mode HILIC)
- Quantification de résidus d’anticancéreux dans le sang de soignants
- Mesures d’exposition aux pesticides par dosage de biomarqueurs d’exposition interne (urine) et externes (patches sur les vêtements)
- Quantification d’adduits à l’ADN (exocycliques, BaP, HAP oxydés) à partir de globules blancs totaux ou les lymphocytes (homme) ou de tissus tels que le foie (animal)
- Quantification de marqueurs épigénétiques (5-MeC et 5-OH-MeC) dans les globules blancs totaux
- Quantification de neurotransmetteurs et de leurs métabolites dans le cerveau, le sang, l’encre de seiche, …
- Quantification de stéroïdes biogéniques dans le sang, la salive, le milieu de culture cellulaire
- Dosage de nucléosides modifiés dans l’urine
- Dosage de principes actifs pharmaceutiques dans le sang, le LCR, le cœur, le cerveau,… dans le cadre d’études pharmacocinétiques ou de stabilité
La plateforme propose les services suivants :
- Préparation d’échantillon par extraction en phase solide (SPE), liquide/liquide, liquide supportée, polymères imprimés (MIP)…
- Purification de composés d’intérêt à l’échelle semi-préparative dans un mélange
- Conseil sur l’échantillonnage
- Réalisation des analyses. L’optimisation et la validation de toutes les étapes de la chaîne d’analyse sont proposées selon les normes en vigueur :
- extraction
- purification
- séparation
- détection
- validation de la méthode d’analyse
- traitement des données
- Analyse des résultats en collaboration avec le demandeur
Équipements
Équipements spécifiques à la plateforme (UNICAEN et LABÉO)
- Automate d’extraction d’acides nucléiques et de préparation des échantillons de bioanalys
- Chaine d’analyse chromatographie liquide couplée à un Spectromètre de masse de type triple quadripôle (UHPLC-UV-ESI-MS/MS, Shimadzu 8030Plus)
- Chaine d’analyse chromatographie liquide couplée à un spectromètre de Masse en tandem avec module d’extraction en ligne (UHPLC-MS/MS 6495, Agilent)
Équipements LABÉO accessibles à la plateforme
- Chaine d’analyse chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse haute résolution LC-HRMS/MS (q-TOF 6540, Agilent)
- Chaine de chromatographie en phase gazeuse avec spectromètre de masse en tandem (GC-MS/MS 7000A Agilent)
Autres équipements de la plateforme :
- Chaine d’analyse UHPLC-UV-DAD (Shimadzu Nexera)
- Chaine d’analyse UHPLC-UV-DAD-Fluorimètre (Agilent)
- Colonne HPLC semi-préparative
- Capacité de stockage des échantillons à +4°C, -20°C et -80°C (-150°C sur demande)
- Système d’extraction en plaque 96 puits (Waters)
- Microcentrifugeuse réfrigérée (Eppendorf)
- Evaporateur (TurboVap LV, Biotage)
Le stockage des données est assuré par les serveurs sécurisés de l’Université de Caen Normandie.
Partenariats et financements
PRISMM est régulièrement soutenue par le Conseil Régional de Normandie et par l’Europe. Les équipements de la plateforme ont ainsi pu être acquis grâce au soutien financier de la Région Normandie et de l’Europe dans le cadre du programme 35301 FEDER. Le projet EquipInnovCaen2022 – Platonus-one est financé par des fonds FEDER dans le cadre du programme opérationnel FEDER/FSE bas-normand 2014-2020.
Informations complémentaires
- 9 personnes au service des projets de la plateforme équivalant à 3,8 temps plein
- 2 300 échantillons analysés par an en moyenne
- 12 publications dans des journaux internationaux à comités de lecture
- 5 étudiants par an formés aux méthodes de bioanalyse basées sur la spectrométrie de masse
Modalités d’accès à la plateforme
Les analyses peuvent être réalisées soit sous forme de partenariats de recherche soit sous forme de prestations de services simples si le dosage fait partie du catalogue de la plateforme (voir « savoir- faire ») ou encore de prestations élargies à la mise au point et à la validation de nouvelles méthodes d’analyse si nécessaire. Dans le cadre d’un partenariat de recherche, une offre de formation du personnel du laboratoire partenaire pourra être proposée.
Pour toute demande d’analyse, il est nécessaire de remplir le formulaire de demande d’analyse en ligne (à venir) afin de permettre à la plateforme d’évaluer la faisabilité du projet et de prendre connaissance des conditions expérimentales. Une réponse est apportée au demandeur dans un délai d’une semaine maximum.