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UMRS 1311 – Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE)

Biologie intégrative imagerie santé environnement

2 rue des Rochambelles · CS 14032
14032 Caen Cedex 5

olivier.join-lambert@unicaen.fr

https://dynamicure.normandie-univ.fr

Identification RNSR : 202224186Y

Tutelle(s) : UNICAEN - université de Rouen Normandie - Inserm

Structure(s) de rattachement :

Organisation

Responsables

Olivier JOIN-LAMBERT, Directeur

  • Jean-Christophe PLANTIER, directeur d’unité
  • Olivier JOIN-LAMBERT, directeur adjoint site de Caen
  • Martine PESTEL-CARON, directrice adjointe site de Rouen

Présentation

L’équipe est composée d’enseignants chercheurs hospitalo-universitaires de Caen et de Rouen exerçant dans des disciplines liées à l’infectiologie et à l’étude des agents pathogènes. Les thématiques de recherche fondamentales développées sont :

  • Adaptation des agents microbiens à l’hôte et dans son environnement, incluant la résistance aux antibiotiques et la persistance
  • Dynamiques évolutives et écologiques associées à l’infection à la circulation épidémique et à l’émergence d’agent pathogènes nouveaux.

Ces thématiques s’appuient sur les ’activités cliniques hospitalières et les activités du Centre National de Référence des virus de la rougeole, oreillons et rubéole (Caen) et du Centre National de Référence du VIH associé (Rouen).

Thèmes de recherche

  • Adaptation et épidémiologie génomique : caractérisation de la diversité génétique des populations microbiennes (virus et bactéries), mise en évidence des variants et clones émergents
  • Adaptation et évolution génétique et clinique : interaction hôte-pathogènes, dynamique évolutive des populations microbiennes au cours de l’infection
  • Adaptation et résistance : pression des molécules thérapeutiques, mécanisme de résistance aux antibiotiques et biocides, impact des vaccins

Domaines d’expertises

  • biologie intégrative
  • biologie de l’évolution
  • franchissements des barrières d’espèces
  • émergence
  • santé – One Health
  • prévention contre le risque infectieux
  • environnement – écologie microbienne
  • microbiomes respiratoires et urinaires

Valorisation

  • Consortium EPICOREM (Eco-Epidemiologie des Coronavirus et Risques d’ EMergence – Coord : Caen)
  • Consortium DisCoVER / LACOVISS (Origine du SARS-CoV2 : Réservoir et Emergence – Coord : Caen)
  • DynaMic’H (Dynamique des microbiomes respiratoires associées aux infections virale – Coord : Caen)
  • Centre national de référence des virus de la rougeole, oreillons et rubéole (Caen)
  • Centre national de référence associé pour le VIH (Rouen)
  • CREM : Cellule Régionale d’Epidémiologie génoMique (coord Caen-Rouen)

Chiffres clé

  • 8 enseignants-chercheurs UNICAEN
  • 6 enseignants-chercheurs université de Rouen Normandie