UMRS 1311 – Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires (DYNAMICURE)

Organisation

Responsables

Olivier JOIN-LAMBERT, Directeur

Présentation

L’équipe est composée d’enseignants chercheurs hospitalo-universitaires de Caen et de Rouen exerçant dans des disciplines liées à l’infectiologie et à l’étude des agents pathogènes. Les thématiques de recherche fondamentales développées sont :

• Adaptation des agents microbiens à l’hôte et dans son environnement, incluant la résistance aux antibiotiques et la persistance
• Dynamiques évolutives et écologiques associées à l’infection à la circulation épidémique et à l’émergence d’agent pathogènes nouveaux.

Ces thématiques s’appuient sur les ’activités cliniques hospitalières et les activités du Centre National de Référence des virus de la rougeole, oreillons et rubéole (Caen) et du Centre National de Référence du VIH associé (Rouen).

Thèmes de recherche

• Adaptation et épidémiologie génomique : caractérisation de la diversité génétique des populations microbiennes (virus et bactéries), mise en évidence des variants et clones émergents
• Adaptation et évolution génétique et clinique : interaction hôte-pathogènes, dynamique évolutive des populations microbiennes au cours de l’infection
• Adaptation et résistance : pression des molécules thérapeutiques, mécanisme de résistance aux antibiotiques et biocides, impact des vaccins

Domaines d’expertises

• biologie intégrative
• biologie de l’évolution
• franchissements des barrières d’espèces
• émergence
• santé – One Health
• prévention contre le risque infectieux
• environnement – écologie microbienne
• microbiomes respiratoires et urinaires

Valorisation

• Consortium EPICOREM (Eco-Epidemiologie des Coronavirus et Risques d’ EMergence – Coord : Caen)
• Consortium DisCoVER / LACOVISS (Origine du SARS-CoV2 : Réservoir et Emergence – Coord : Caen)
• DynaMic’H (Dynamique des microbiomes respiratoires associées aux infections virale – Coord : Caen)
• Centre national de référence des virus de la rougeole, oreillons et rubéole (Caen)
• Centre national de référence associé pour le VIH (Rouen)
• CREM : Cellule Régionale d’Epidémiologie génoMique (coord Caen-Rouen)